長(zhǎng)沙晚報(bào)掌上長(zhǎng)沙10月20日訊（全媒體記者 彭放 通訊員 王涵）自疫情發(fā)生以來(lái),，隨著精準(zhǔn)化防控的開展，“基因測(cè)序”一詞常常被提及,，除了核酸檢測(cè),，大家也開始關(guān)注基因測(cè)序的結(jié)果。疫情源頭在哪里,？除了流行病學(xué)調(diào)查,，還有沒有更簡(jiǎn)便精準(zhǔn)的方法來(lái)確定傳播鏈條？這些問題都要借助基因測(cè)序的科技力量一一解開,。今日,，記者跟隨長(zhǎng)沙市疾控中心基因測(cè)序項(xiàng)目組，了解新冠病毒全基因組測(cè)序的方方面面,。

　　長(zhǎng)沙市疾控中心基因測(cè)序項(xiàng)目組骨干成員,、微生物檢驗(yàn)科技師黃政介紹,，新冠病毒基因測(cè)序是對(duì)陽(yáng)性病例鼻咽拭子標(biāo)本中新冠病毒核苷酸序列的獲取。這種基因測(cè)序技術(shù)是基于納米孔的三代基因測(cè)序,，從而能夠在較短時(shí)間內(nèi)獲得新冠病毒的全基因組序列,，結(jié)合流行病學(xué)資料，既可以判斷新冠病毒疫情的感染來(lái)源,，又可以對(duì)多個(gè)病例感染的病毒基因進(jìn)行測(cè)序,，判斷是否為同一傳播鏈，從而為疫情防控方案的制定提供重要依據(jù),。這項(xiàng)技術(shù)已經(jīng)成為目前新冠病毒溯源分型的主要手段,。

　　如果說(shuō)核酸檢測(cè)是為了發(fā)現(xiàn)病例，那么,，基因測(cè)序是為了對(duì)發(fā)現(xiàn)的病例進(jìn)一步進(jìn)行流行病學(xué)分子溯源,，協(xié)助現(xiàn)場(chǎng)流行病學(xué)調(diào)查查找感染源頭和傳播鏈條。譬如可以判斷為外省或外地輸入病例，甚至可以根據(jù)核苷酸突變的情況判斷為本地病例的二代傳播,、三代傳播,。簡(jiǎn)單的說(shuō)，病毒基因測(cè)序用于流行病學(xué)的分子溯源調(diào)查,，相當(dāng)于病毒的“親子鑒定”,。

　　“基因測(cè)序技術(shù)發(fā)展很快，從一代,、二代,，發(fā)展到目前的三代。長(zhǎng)沙市疾控中心實(shí)驗(yàn)室使用的就是三代測(cè)序設(shè)備,?！秉S政介紹，和二代測(cè)序需要36～48小時(shí)相比,，而三代測(cè)序的時(shí)間縮短到了12小時(shí)內(nèi),。流調(diào)溯源時(shí)間縮短，為疫情防控措施的制定節(jié)約了寶貴的時(shí)間和資源,，有利于更精準(zhǔn)的防控,，減輕對(duì)社會(huì)和經(jīng)濟(jì)的壓力。

　　近一個(gè)月,，團(tuán)隊(duì)共對(duì)35份樣本開展了三代測(cè)序,，結(jié)合流行病學(xué)調(diào)查，精準(zhǔn)判斷多起感染來(lái)源和傳播鏈條,。國(guó)慶期間,，一名本地病例的感染源頭一時(shí)難以確定。盡管經(jīng)過(guò)流行病學(xué)調(diào)查,，發(fā)現(xiàn)其與一名外省輸入病例可能有時(shí)空交集,，但流調(diào)隊(duì)員反復(fù)查看現(xiàn)場(chǎng)監(jiān)控視頻，未發(fā)現(xiàn)兩人共同暴露于同一個(gè)環(huán)境中,。最終，通過(guò)三代基因測(cè)序,，發(fā)現(xiàn)這兩人的病毒基因序列高度同源,，判斷兩人為同一傳播鏈，為流行病學(xué)調(diào)查指明了方向,。

　　長(zhǎng)沙市疾控中心基因測(cè)序項(xiàng)目組是一個(gè)平均年齡不到30歲的年輕團(tuán)隊(duì),。他們?cè)诔袚?dān)繁重的新冠核酸日常檢測(cè)工作之余，一旦本市出現(xiàn)新冠病毒核酸檢測(cè)陽(yáng)性人員,，項(xiàng)目組便馬上對(duì)陽(yáng)性樣品啟動(dòng)基因測(cè)序,。由于每天核酸檢測(cè)大多晚上才出結(jié)果，基因測(cè)序工作往往在后半夜進(jìn)行,，項(xiàng)目組不分晝夜,，分秒必爭(zhēng),，絕大多數(shù)三代基因測(cè)序分析結(jié)果在凌晨3時(shí)以后發(fā)出。他們用“白加黑,、連軸轉(zhuǎn)”的辛勤付出,，為長(zhǎng)沙市疫情防控流調(diào)溯源提供數(shù)據(jù)支撐，發(fā)揮了實(shí)驗(yàn)室的“一錘定音”作用,。